Geber86 / Getty Images
Key Takeaways
- Bērnu slimnīca Losandželosā veica līdz šim lielāko bērnu genomisko pētījumu COVID-19.
- Pētījums ziņo par iespējamu saikni starp dažām SARS-CoV-2 mutācijām un slimības smagumu.
- Paraugi Kalifornijā parādīja augstu ģenētisko variāciju līmeni.
Tāpat kā daudzi vīrusi, arī SARS-CoV-2, vīruss, kas izraisa COVID-19, izplešas lielā populācijā, iziet daudz ģenētisku mutāciju. Zinātnieki tikai sāk saprast šīs variācijas un to ietekmi uz veselības rezultātiem, īpaši bērniem.
Līdz šim lielākajā bērnu genomiskajā COVID-19 pētījumā Losandželosas Bērnu slimnīcas komanda atrada saikni starp vīrusu mutācijām un slimības smagumu. Novembra pētījums tika publicēts žurnālāAtklātā foruma infekcijas slimības.
"Ja mēs varam kaut ko darīt, lai uzzinātu, vai pastāv kāda sakarība starp vīrusu genoma mutācijas ģenētiku un slimības fenotipu (COVID-19 novērojamās īpašības), jūs varat informēt par to, kā vislabāk ārstēt pacientu," Xiaowu Gai , Doktors, viens no pētījuma autoriem un bioinformātikas direktors Bērnu slimnīcā Losandželosā, stāsta Verywell.
Cenšoties labāk izprast, kā ģenētiskās variācijas var ietekmēt bērnu populāciju, pētnieku grupa analizēja vīrusa ģenētisko informāciju no 141 inficēta bērna no 13. marta līdz 16. jūnijam. Šie paraugi parādīja augstu variāciju līmeni un izplatītas izplatības izplatību. mutācija, kas saistīta ar augstākiem pārraides ātrumiem.
Ko tas jums nozīmē
SARS-CoV-2, vīrusa, kas izraisa COVID-19, ģenētiskais materiāls nepārtraukti attīstās. Zinātnieki strādā, lai saprastu, kā ģenētiskās mutācijas var ietekmēt vīrusa pārnešanu un slimības smagumu inficētiem pacientiem.
Nepārtraukti mainīgs vīruss
Mutācijas ir kļūdas, kas rodas vīrusa genomā vai ģenētiskajā materiālā, kad tas atkārtojas. Lielākajai daļai vīrusu ir zināmas variācijas, kad tie apritē populācijā. SARS-CoV-2 gadījumā daudzas mutācijas ir nenozīmīgas vai pat var vājināt vīrusu. Citi tomēr var ietekmēt vīrusa pārnešanas vieglumu un pat slimības smagumu.
"Kad daudzi cilvēki domā par COVID-19, viņi domā par šo vienu lietu, šo īpatnību," saka Gai. "Bet tas nav tas, kā mēs uz to skatāmies. Vīruss jebkura pacienta ķermenī ar vīrusu infekciju ir daudz dažādu šī vīrusa kopiju sajaukums. ”
Viena izplatīta mutācija, ko sauc par D614G, izraisa izmaiņas vīrusa smaile proteīnā.Lai gan tā nebija izplatīta, kad vīruss sāka izplatīties visā pasaulē šā gada sākumā, versija kopš tā laika ir kļuvusi dominējoša visā pasaulē. Autori ziņo, ka tas bija 99,3% no viņu savāktajiem bērnu paraugiem.
D614G mutācija, kas palielina smailes proteīnu, ko vīruss izmanto, lai iekļūtu cilvēka šūnās, ļauj vīrusam vieglāk pārnēsāt. Pagaidām nav pārliecinošu pierādījumu tam, ka šī mutācija maina slimības simptomu smagumu.
COVID-19 smaile proteīns ir starpnieks koronavīrusa iekļūšanai saimniekšūnā.
Pētnieku grupa tomēr atrada saikni starp 20C klātu - vīrusa mutācijas versiju - un smagākiem simptomiem. Klades 20A, 20B un 20C ir visas nesen mutētās vīrusa versijas. Visi smagie pediatrijas gadījumi un visi vidēji smagie gadījumi, izņemot vienu, šajā pētījumā bija vīrusa versija ar klātu 20C.
Mutāciju sekas
"Kad sabiedrība skatās uz šādu paziņojumu, izklausās biedējoši, ka vīruss mutē," Verywell saka Stjuarts Kempbels Rejs, infekcijas slimību eksperts un medicīnas profesors Džona Hopkinsa universitātē. “Bet visiem RNS vīrusiem ir mutācijas ātrums. Un SARS-CoV-2 mutācijas ātrums ir apmēram piecas reizes lēnāks nekā gripa - vismaz tā tas ir bijis līdz šim. ”
Šis salīdzinoši lēns mutāciju līmenis var būt noderīgs zinātniekiem, kuri mēģina tikt galā ar jauno vīrusu. Tomēr Rejs brīdina, ka, pieaugot inficēto cilvēku populācijai, palielināsies arī mutāciju ātrums.
Ieviešot risinājumus imūnsistēmas atbalstam pret vīrusu infekciju - piemēram, vakcināciju, iepriekšēju iedarbību uz vīrusu, atveseļošanos plazmā un antivielu terapiju - SARS-CoV-2 var attīstīties, lai izvairītos no imūnreakcijas. Tas nozīmē, ka ir iespējams, ka vakcīnu kandidāti, kas šobrīd ir daudzsološi, nākamajos mēnešos var kļūt mazāk efektīvi, jo vīruss turpina mutēt.
"Pastāv risks - jo šī pandēmija ir nekontrolējama - ka šīs mutācijas var uzkrāties un var notikt tieši tās pareizās, kas var izvairīties no imūnreakcijas," saka Rejs, kurš nav saistīts ar pētījumu.
Vakcīnas, kas ir izrādījušās efektīvas, joprojām aizsargās ķermeni pret vīrusu. Bet, kā tas ir ar citiem plaši izplatītiem vīrusiem, piemēram, gripu, var būt nepieciešamas papildu vai jaunas vakcīnas versijas, lai aptvertu visus jaunus vīrusa celmus, kas parādās nākotnē.
Darbība ar nezināmiem mainīgajiem
Lai gan tiek ziņots, ka bērniem COVID-19 bieži ir mazāk smaga nekā pieaugušie, saskaņā ar pētījumu ICU tiek uzņemts katrs trešais bērns, kurš hospitalizēts šīs slimības dēļ. Gai saka, ka tiem pacientiem, kuriem ir smaga slimības gaita. slimība, vīrusa ģenētiskā sastāva izpratne varētu sniegt zināmu ieskatu ārstēšanas attīstībā.
Tomēr pats vīrusa sastāvs tikai tik daudz var pateikt ģenētiķiem par to, kā tas ietekmēs inficētos cilvēkus. Viņiem jāņem vērā arī inficētās personas demogrāfiskie dati un ģenētiskā informācija.
Gai brīdina, ka, lai arī šie atklājumi var norādīt uz korelāciju starp noteiktām mutācijām un to rezultātiem, tomēr ir vajadzīgi daudzi lielāki pētījumi, lai parādītu, ka mutācija noteikti izraisa smagākas slimības. Neskatoties uz līdz šim lielāko pedagoģisko bērnu COVID-19 pētījumu, tajā piedalījās tikai 141 bērns.
"Tas patiesībā nav ļoti liels izlases lielums," saka Gai. "Mēs, iespējams, nevaram veikt korelācijas analīzi katrai atsevišķai mutācijai ar slimības fenotipu."
Turklāt pētījumā netika ņemtas vērā vecuma, dzimuma, iepriekšējo apstākļu un citu svarīgu faktoru atšķirības. Atzinumus, kas saistīti ar pacientu vīrusu slodzi, var arī izkropļot, pamatojoties uz to, kad no pacientiem tika ņemti paraugi. Tomēr pētījums veicina arvien vairāk zināšanu par to, kā ģenētiskās variācijas var veidot svarīgus veselības rezultātus.
"Mums ir nepieciešami šādi ziņojumi, lai saprastu, kā vīruss attīstās," saka Rejs. "Šādu pētījumu secībām, apvienojot tās ar sekvencēm no visas pasaules, ir liela vērtība, palīdzot mums saprast, kā šis vīruss attīstās un vai mums ir jāpielāgo savas stratēģijas, lai to pārvaldītu."